Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apba1B2RUJ5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apba1B2RUJ5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms