Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrn3B2RS91 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrn3B2RS91 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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