Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgr4A2ARI4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr4A2ARI4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms