Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700023F06RikA2AB62 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700023F06RikA2AB62 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms