Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trav12-2A0N8N6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trav12-2A0N8N6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trav12-2A0N8N6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trav12-2A0N8N6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trav12-2A0N8N6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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