Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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