Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms