Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
IFFO1Q0D2I5 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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