Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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