Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SHBQ15464 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SHBQ15464 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SHBQ15464 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SHBQ15464 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SHBQ15464 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SHBQ15464 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SHBQ15464 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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