Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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