Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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RASGEF1AQ8N9B8 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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