Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
APOC4-APOC2K7ER74 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms