Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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