Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC018892.2-201ENST00000457656 693 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC133569.1-201ENST00000564327 373 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AP000436.1-201ENST00000605239 800 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 C18orf12-201ENST00000623329 537 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms