Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms