Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CYP3A43-202ENST00000312017 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL157895.1-201ENST00000451713 1404 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL353611.1-201ENST00000417054 462 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 DHRS9-203ENST00000421653 1044 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 HNRNPA1P17-201ENST00000496620 924 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CCDC58P5-201ENST00000536923 432 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CYP4A26P-201ENST00000563017 196 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC011509.2-201ENST00000592263 627 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC005070.1-201ENST00000603744 365 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 EIF4A1P13-201ENST00000415667 230 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms