Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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