Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms