Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd1Q9Z2E2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms