Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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