Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RfxankQ9Z205 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RfxankQ9Z205 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms