Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nup160Q9Z0W3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup160Q9Z0W3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms