Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NgfrQ9Z0W1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NgfrQ9Z0W1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NgfrQ9Z0W1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NgfrQ9Z0W1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NgfrQ9Z0W1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NgfrQ9Z0W1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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