Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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