Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapaQ9WV55 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms