Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms