Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms