Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4eQ9R0Q8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4eQ9R0Q8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4eQ9R0Q8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4eQ9R0Q8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clec4eQ9R0Q8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4eQ9R0Q8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4eQ9R0Q8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Clec4eQ9R0Q8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4eQ9R0Q8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Clec4eQ9R0Q8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Clec4eQ9R0Q8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Clec4eQ9R0Q8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Clec4eQ9R0Q8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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