Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Gpc6Q9R087 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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