Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AmfrQ9R049 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AmfrQ9R049 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms