Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf4Q9QZS2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf4Q9QZS2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms