Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc5Q9QX29 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc5Q9QX29 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms