Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dclk1Q9JLM8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dclk1Q9JLM8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms