Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms