Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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