Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc12a4Q9JIS8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a4Q9JIS8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms