Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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