Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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