Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Praf2Q9JIG8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Praf2Q9JIG8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms