Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgi1Q9JIA1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.8 ms