Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms