Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms