Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Trim39Q9ESN2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trim39Q9ESN2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim39Q9ESN2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trim39Q9ESN2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trim39Q9ESN2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms