Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa13Q9ERS2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa13Q9ERS2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa13Q9ERS2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufa13Q9ERS2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufa13Q9ERS2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufa13Q9ERS2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufa13Q9ERS2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Ndufa13Q9ERS2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms