Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barx1Q9ER42 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms