Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms