Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr1Q9EPQ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms