Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxp4Q9DBY0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Foxp4Q9DBY0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms