Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkar1aQ9DBC7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkar1aQ9DBC7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms